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Assoz. Prof. Dipl.-Biol. Dr. Robert Ahrends, Privatdoz.
T: +43-1-4277-52304
Sommersemester 2023
301620 VO Analytische Chemie 2 für Biologen - Biophysical Methods for Biological Macromolecules
Wintersemester 2022
270013 SE Erstellen der Bachelorarbeit B - Analytische Chemie + Lebensmittelchemie
270103 PR Wahlfachpraktikum B (Bachelormodul) - Analytische Chemie + Lebensmittelchemie
270241 PR Lipidomics
270243 VO Lipidomics
Ni, Z., Wolk, M., Jukes, G., Espinosa, K. M., Ahrends, R., Aimo, L., Alvarez-Jarreta, J., Andrews, S., Andrews, R., Bridge, A., Clair, G. C., Conroy, M. J., Fahy, E., Gaud, C., Goracci, L., Hartler, J., Hoffmann, N., Kopczynski, D., Korf, A., ... Fedorova, M. (2023). Guiding the choice of informatics software and tools for lipidomics research applications. Nature Methods. https://doi.org/10.1038/s41592-022-01710-0


McDonald, J. G., Ejsing, C. S., Kopczynski, D., Holcapek, M., Aoki, J., Arita, M., Arita, M., Baker, E. S., Bertrand-Michel, J., Bowden, J. A., Brugger, B., Ellis, S. R., Fedorova, M., Griffiths, W. J., Han, X., Hartler, J., Hoffmann, N., Koelmel, J. P., Kofeler, H. C., ... Ekroos, K. (2022). Introducing the Lipidomics Minimal Reporting Checklist. Nature Metabolism, 4(9), 1086-1088. https://doi.org/10.1038/s42255-022-00628-3

Kumar, M., Has, C., Lam-Kamath, K., Ayciriex, S., Dewett, D., Bashir, M., Poupault, C., Schuhmann, K., Knittelfelder, O., Raghuraman, B. K., Ahrends, R., Rister, J., & Shevchenko, A. (2022). Vitamin A Deficiency Alters the Phototransduction Machinery and Distinct Non-Vision-Specific Pathways in the Drosophila Eye Proteome. Biomolecules, 12(8), [1083]. https://doi.org/10.3390/biom12081083

Hoffmann, N., Mayer, G., Has, C., Kopczynski, D., Al Machot, F., Schwudke, D., Ahrends, R., Marcus, K., Eisenacher, M., & Turewicz, M. (2022). A Current Encyclopedia of Bioinformatics Tools, Data Formats and Resources for Mass Spectrometry Lipidomics. Metabolites, 12(7), [584]. https://doi.org/10.3390/metabo12070584

Ariens, R. A., Hunt, B. J., Agbani, E. O., Ahnstrom, J., Ahrends, R., Alikhan, R., Assinger, A., Bagoly, Z., Balduini, A., Barbon, E., Barrett, C. D., Batty, P., Carneiro, J. D. A., Chan, W. S., de Maat, M., de Wit, K., Denis, C., Ellis, M. H., Eslick, R., ... Zhou, J. (2022). Illustrated State-of-the-Art Capsules of the ISTH 2022 Congress. Research and practice in thrombosis and haemostasis, 6(5), [e12747]. https://doi.org/10.1002/rth2.12747



Michel, L., Helfrich, I., Hendgen-Cotta, U. B., Mincu, R-I., Korste, S., Mrotzek, S. M., Spomer, A., Odersky, A., Rischpler, C., Herrmann, K., Umutlu, L., Coman, C., Ahrends, R., Sickmann, A., Löffek, S., Livingstone, E., Ugurel, S., Zimmer, L., Gunzer, M., ... Rassaf, T. (2022). Targeting early stages of cardiotoxicity from anti-PD1 immune checkpoint inhibitor therapy. European Heart Journal, 43(4), 316-329. https://doi.org/10.1093/eurheartj/ehab430

Wolrab, D., Jirasko, R., Cifkova, E., Horing, M., Mei, D., Chocholouskova, M., Peterka, O., Idkowiak, J., Hrnciarova, T., Kuchar, L., Ahrends, R., Brumarova, R., Friedecky, D., Vivo-Truyols, G., Skrha, P., Skrha, J., Kucera, R., Melichar, B., Liebisch, G., ... Holcapek, M. (2022). Lipidomic profiling of human serum enables detection of pancreatic cancer. Nature Communications, 13(1), [124]. https://doi.org/10.1038/s41467-021-27765-9

Confettura, A. D., Cuboni, E., Ammar, M. R., Jia, S., Gomes, G. M., Yuanxiang, P., Raman, R., Li, T., Grochowska, K. M., Ahrends, R., Karpova, A., Dityatev, A., & Kreutz, M. R. (2022). Neddylation-dependent protein degradation is a nexus between synaptic insulin resistance, neuroinflammation and Alzheimer's disease. Translational neurodegeneration, 11(1), [2]. https://doi.org/10.1186/s40035-021-00277-8

Borgmeyer, M., Coman, C., Has, C., Schoett, H-F., Li, T., Westhoff, P., Cheung, Y. F. H., Hoffmann, N., Yuanxiang, P., Behnisch, T., Gomes, G. M., Dumenieu, M., Schweizer, M., Chocholouskova, M., Holcapek, M., Mikhaylova, M., Kreutz, M. R., & Ahrends, R. (2021). Multiomics of synaptic junctions reveals altered lipid metabolism and signaling following environmental enrichment. Cell Reports, 37(1), [109797]. https://doi.org/10.1016/j.celrep.2021.109797

Manke, M-C., Geue, S., Coman, C., Peng, B., Kollotzek, F., Muenzer, P., Walker, B., Huber, S. M., Rath, D., Sickmann, A., Stegner, D., Duerschmied, D., Lang, F., Nieswandt, B., Gawaz, M., Ahrends, R., & Borst, O. (2021). ANXA7 Regulates Platelet Lipid Metabolism and Ca2+ Release in Arterial Thrombosis. Circulation Research, 129(4), 494-507. https://doi.org/10.1161/CIRCRESAHA.121.319207

Koefeler, H. C., Eichmann, T. O., Ahrends, R., Bowden, J. A., Danne-Rasche, N., Dennis, E. A., Fedorova, M., Griffiths, W. J., Han, X., Hartler, J., Holcapek, M., Jirasko, R., Koelmel, J. P., Ejsing, C. S., Liebisch, G., Ni, Z., O'Donnell, V. B., Quehenberger, O., Schwudke, D., ... Ekroos, K. (2021). Quality control requirements for the correct annotation of lipidomics data. Nature Communications, 12(1), [4771]. https://doi.org/10.1038/s41467-021-24984-y


Koefeler, H. C., Ahrends, R., Baker, E. S., Ekroos, K., Han, X., Hoffmann, N., Holcapek, M., Wenk, M. R., & Liebisch, G. (2021). Recommendations for good practice in MS-based lipidomics. Journal of Lipid Research, 62, [100138]. https://doi.org/10.1016/j.jlr.2021.100138


van Geffen, J. P., Swieringa, F., van Kuijk, K., Tullemans, B. M. E., Solari, F. A., Peng, B., Clemetson, K. J., Farndale, R. W., Dubois, L. J., Sickmann, A., Zahedi, R. P., Ahrends, R., Biessen, E. A. L., Sluimer, J. C., Heemskerk, J. W. M., & Kuijpers, M. J. E. (2020). Mild hyperlipidemia in mice aggravates platelet responsiveness in thrombus formation and exploration of platelet proteome and lipidome. Scientific Reports, 10(1), [21407]. https://doi.org/10.1038/s41598-020-78522-9

Michel, L., Hendgen-Cotta, U. B., Mincu, R., Helfrich, E. J. N., Korste, S., Mrolzek, S. M., Rischpler, C., Herrmann, K., Ugurel, S., Zimmer, L., Coman, C., Ahrends, R., Schadendorf, D., Rassaf, T., & Totzeck, M. (2020). Preclinical and clinical assessment of immune checkpoint inhibitor-associated left ventricular dysfunction. European Heart Journal, 41, 3260-3260.

Kopczynski, D., Hentschel, A., Coman, C., Schebb, N. H., Hornemann, T., Mashek, D. G., Hartung, N. M., Shevchuk, O., Schott, H-F., Lorenz, K., Torta, F., Burla, B., Zahedi, R. P., Sickmann, A., Kreutz, M. R., Ejsing, C. S., Medenbach, J., & Ahrends, R. (2020). Simple Targeted Assays for Metabolic Pathways and Signaling: A Powerful Tool for Targeted Proteomics. Analytical Chemistry, 92(20), 13672-13676. https://doi.org/10.1021/acs.analchem.0c02793

Mass spectrometric analysis; QQQ, HRMS, Type-II overlap, annotation, MS, MSMS, MSn, Imaging

Robert Ahrends (Invited speaker) & Harald C. Köfeler (Autor*in)

9 Sep. 2022

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Probing Membranes & Identifying Key Lipids Critical for Platelet Activation by Lipidomics

Robert Ahrends (Invited speaker)

9 Juli 2022

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Probing Membranes & Identifying Key Lipids Critical for Platelet Activation by Lipidomics

Robert Ahrends (Vortragende*r)

5 Juli 2022

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Probing the Membrane Landscape and Identifying Key Lipids Critical for Platelet Activation by Lipidomics

Robert Ahrends (Vortragende*r)

5 Juli 2022

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Probing the Platelet Lipidome From Lipid Structure to Function

Robert Ahrends (Invited speaker)

21 Juni 2022

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


A synaptoneurolipidomics view on neuronal plasticity

Cristina Coman (Invited speaker), Maximilian Borgmeyer (Autor*in), Marina Mikhaylova (Autor*in), M.R. Kreutz (Autor*in) & Robert Ahrends (Autor*in)

13 Mai 2022

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Dissecting the Platelet Lipidome

Robert Ahrends (Invited speaker)

12 Mai 2022

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


A lipid-centric multiomics approach

Robert Ahrends (Invited speaker)

27 Apr. 2022

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Beyond good lipidomics practice

Robert Ahrends (Invited speaker), Dominik Kopczynski (Autor*in) & Gerhard Liebisch (Autor*in)

8 Apr. 2022

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


A Lipid-centric Multiomics Approach for Complex Systems

Robert Ahrends (Invited speaker)

30 März 2022

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


The LIFS tools and workflows for mass-spectrometry based lipidomics

Robert Ahrends (Invited speaker)

8 März 2022

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Lipidomics: From Lipid structure to lipid function

Robert Ahrends (Invited speaker)

6 Jan. 2022

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Probing the platelet lipidome from lipid structure to function

Robert Ahrends (Vortragende*r)

9 Dez. 2021

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Lipidomics from structure to function new frontiers in lipid research

Cristina Coman (Vortragende*r), Maximilian Borgmeyer (Autor*in), Michael R. Kreutz (Autor*in) & Robert Ahrends (Autor*in)

26 Nov. 2021

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Multiomics reveals altered lipid metabolism and signaling upon environmental enrichment in synaptic junctions

Cristina Coman (Vortragende*r), Maximilian Borgmeyer (Autor*in), Canan Has (Autor*in), Hans-Frieder Schott (Autor*in), Tingting Li (Autor*in), Philipp Westhoff (Autor*in), Hilaire Yam Fung Cheung (Autor*in), Nils Hoffmann (Autor*in), Michaela Schweizer (Autor*in), Michal Holcapek (Autor*in), Marina Mikhaylova (Autor*in), Michael R. Kreutz (Autor*in) & Robert Ahrends (Autor*in)

9 Nov. 2021

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


A comprehensive and quantitative multiomics analysis of murine megakaryocytes during maturation

Bianca de Jonckheere (Vortragende*r) & Robert Ahrends (Autor*in)

20 Okt. 2021

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


A targeted lipidomics workflow to dissect sphingolipid metabolism in adipogenesis

Nina Nicole Troppmair (Vortragende*r) & Robert Ahrends (Autor*in)

20 Okt. 2021

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Development and Application of Chromatographic Methods for Lipidomic Analyses

Stefanie Rubenzucker (Vortragende*r) & Robert Ahrends (Autor*in)

20 Okt. 2021

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


LipidCreator workbench to probe the lipidomics landscape

Bing Peng (Autor*in), Dominik Kopczynski (Vortragende*r), Cristina Coman (Autor*in), Nils Hoffmann (Autor*in) & Robert Ahrends (Autor*in)

7 Okt. 2021

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Multiomics of synaptic junctions reveals altered lipid metabolism and signaling upon environmental enrichment

Cristina Coman (Vortragende*r), Maximilian Borgmeyer (Autor*in), Canan Has (Autor*in), Hans-Frieder Schott (Autor*in), Tingting Li (Autor*in), Philipp Westhoff (Autor*in), Hilaire Yam Fung Cheung (Autor*in), Nils Hoffmann (Autor*in), Michaela Schweizer (Autor*in), Michal Holcapek (Autor*in), Marina Mikhaylova (Autor*in), Michael R. Kreutz (Autor*in) & Robert Ahrends (Autor*in)

5 Okt. 2021

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Probing the platelet lipidome and identifying key lipids critical for platelet activation by comprehensive lipidomics

Robert Ahrends (Vortragende*r) & Oliver Borst (Autor*in)

5 Okt. 2021

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


The LIFS tools and workflows for mass-spectrometry based lipidomics

Nils Hoffmann (Vortragende*r) & Robert Ahrends (Autor*in)

5 Okt. 2021

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


The lipid crosstalk of thrombo-inflammatory cells and its modulating effect on thrombus formation

Robert Ahrends (Vortragende*r) & Patrick Münzer (Autor*in)

27 Sep. 2021

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science



A KNIME workflow for processing data from targeted lipidomics approaches

Nina Nicole Troppmair (Vortragende*r) & Robert Ahrends (Autor*in)

11 Juni 2021

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Lipidomic analysis of murine megakaryocytes during maturation

Bianca de Jonckheere (Vortragende*r) & Robert Ahrends (Autor*in)

11 Juni 2021

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


LipidCreator

Robert Ahrends (Invited speaker)

12 Apr. 2021

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Lipid Compass probing the lipidomics landscape

Robert Ahrends (Invited speaker)

1 März 2021

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


LIFS Bioinformatics / Data Integration and Applications

Robert Ahrends (Vortragende*r)

29 Sep. 2020

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


LipidCreator workbench to probe the lipidomic landscape

Robert Ahrends (Vortragende*r)

13 Juli 2020

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Lipid Creator

Robert Ahrends (Vortragende*r)

17 Apr. 2020

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Lipid Compass

Nils Hoffmann (Vortragende*r) & Robert Ahrends (Autor*in)

1 März 2020

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Lipidomics Bioinformatics for Life Sciences

Robert Ahrends (Invited speaker)

1 März 2020

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


LipidCreator: A workbench to probe the lipidomic landscape

Robert Ahrends (Vortragende*r)

25 Feb. 2020

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


LILY-Lipidome Isotope Labeling of Yeast: In vivo synthesis of 13C labeled reference lipids for quantification by mass spectrometry

Evelyn Rampler (Vortragende*r), Cristina Coman (Autor*in), Gerrit Hermann (Autor*in), Kristaps Klavins (Autor*in), Robert Ahrends (Autor*in) & Gunda Köllensperger (Autor*in)

13 Nov. 2016

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Production of 13C labeled reference lipids for absolute quantification by mass spectrometry

Evelyn Rampler (Vortragende*r), Cristina Coman (Autor*in), Gerrit Hermann (Autor*in), Kristaps Klavins (Autor*in), Robert Ahrends (Autor*in) & Gunda Köllensperger (Autor*in)

5 Sep. 2016

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Rückkoppelungsschleifen der Fettzelldifferenzierung im Visier

Ahrends, R.

1/03/2028/02/23

Projekt: Forschungsförderung


Institut für Analytische Chemie

Währinger Straße 38
1090 Wien

T: +43-1-4277-52304

robert.ahrends@univie.ac.at