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Univ.-Prof. Dipl.-Biol. Dr. Holger Daims





Daebeler, A., Kitzinger, K., Koch, H., Herbold, C., Steinfeder, M., Schwarz, J., Zechmeister, T., Karst, S. M., Albertsen, M., Nielsen, P. H., Wagner, M., & Daims, H. (2020). Exploring the upper pH limits of nitrite oxidation: diversity, ecophysiology, and adaptive traits of haloalkalitolerant Nitrospira. ISME Journal, 14, 2967-2979. https://doi.org/10.1038/s41396-020-0724-1



Kitzinger, K., Marchant, H. K., Bristow, L. A., Herbold, C. W., Padilla, C. C., Kidane, A. T., Littmann, S., Daims, H., Pjevac, P., Stewart, F. J., Wagner, M., & Kuypers, M. M. M. (2020). Single cell analyses reveal contrasting life strategies of the two main nitrifiers in the ocean. Nature Communications, 11(1), [767]. https://doi.org/10.1038/s41467-020-14542-3






Sorokin, D. Y., Lücker, S., & Daims, H. (2018). Nitrolancea. in Bergey’s Manual of Systematics of Archaea and Bacteria John Wiley & Sons, Inc.. https://doi.org/10.1002/9781118960608.gbm01563


Mueller, A. J., Herbold, C., Kirkegaard, R. H., & Daims, H. (2018). Cultivation and Genomic Characterization of Novel Marine Nitrite-oxidizing Bacteria. Postersitzung präsentiert bei ISME17 - 17th Meeting of the International Society for Microbial Ecology, Leipzig, Deutschland.

Wiesinger, J., Romano, S., Eberl, L., Mellbye, B. L., Sayavedra-Soto, L. A., Bottomley, P. J., Uhl, J., Schmitt-Kopplin, P., Daims, H., & Wagner, M. (2018). Quorum sensing in the comammox bacterium Nitrospira inopinata. Postersitzung präsentiert bei ISME17 - 17th Meeting of the International Society for Microbial Ecology, Leipzig, Deutschland.

Kitzinger, K., Koch, H., Lücker, S., Sedlacek, C. J., Herbold, C., Schwarz, J., Daebeler, A., Mueller, A. J., Lukumbuzya, M., Romano, S., Leisch, N., Karst, S. M., Kirkegaard, R., Albertsen, M., Nielsen, P. H., Wagner, M., & Daims, H. (2018). Characterization of the First “Candidatus Nitrotoga" Isolate Reveals Metabolic Versatility and Separate Evolution of Widespread Nitrite-Oxidizing Bacteria. mBio, 9(4), [01186-18]. https://doi.org/10.1128/mBio.01186-18


Nitrification: A Bag Full of Surprises!

Anna Julia Mueller (Vortragende*r) & Holger Daims (Vortragende*r)

8 Okt. 2019

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Stickstoff-Eliminierung in der Abwasserreinigung: Überraschungen aus der Mikrobiologie.

Holger Daims (Invited speaker)

4 Sep. 2019

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Metabolic versatility, complete ammonia oxidizers, And more: A new perspective on the nitrifying microorganisms.

Holger Daims (Invited speaker)

9 Juli 2019

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science



Metabolic versatility, complete ammonia oxidizers, and more: A new perspective on the nitrifying microorganisms

Holger Daims (Invited speaker)

5 Nov. 2018

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Nitric oxide and nitrous oxide production by complete ammonia oxidizers (comammox)

Holger Daims (Vortragende*r)

19 Sep. 201821 Sep. 2018

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Stickstoffkreisläufe in der Abwasserreinigung – neue und bewährte Wege

Holger Daims (Invited speaker)

27 Feb. 2018

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Sleep, stress and the Black Queen: Microbial hidden activities and cooperation

Holger Daims (Invited speaker)

7 Sep. 2017

Aktivität: VorträgeVortragScience to Science


Complete nitrification by one organism: The discovery and characterization of comammox.

Holger Daims (Invited speaker)

12 Okt. 2016

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Microcolony mini-metagenomics of active nitrifiers.

Holger Daims (Invited speaker)

11 Okt. 2016

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Complete nitrification by one organism: The discovery and characterization of comammox.

Holger Daims (Invited speaker)

21 Aug. 201626 Aug. 2016

Aktivität: VorträgeVortragAndere



Complete nitrification by one organism: The discovery and characterization of comammox.

Holger Daims (Keynote speaker)

16 Juni 201620 Juni 2016

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Repainting our picture of nitrite-oxidizing bacteria.

Holger Daims (Invited speaker)

14 Jan. 2016

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Flexible friends or foes: Recent insights add fresh paint to our picture of nitrite-oxidizing bacteria

Holger Daims (Invited speaker)

28 Juni 20151 Juli 2015

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Raman-based sorting of microbes with defined functional properties for single-cell genomics

Holger Daims (Invited speaker)

14 Juni 201518 Juni 2015

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Cyanate: A novel substrate for nitrification by ammonia-oxidizing archaea and nitrite-oxidizing bacteria.

Holger Daims (Vortragende*r)

10 Sep. 201412 Sep. 2014

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Tales of partnership and crime: Interactions of autotrophic and heterotrophic microorganisms.

Holger Daims (Invited speaker)

24 Aug. 201429 Aug. 2014

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Surprising versatility and multiple roots: News on the ecophysiology and evolution of nitrite-oxidizing bacteria.

Holger Daims (Invited speaker)

17 Mai 201420 Mai 2014

Aktivität: VorträgeVortragAndere










Nitrification: Ammonia- and Nitrite-Oxidizing Bacteria

Holger Daims (Invited speaker)

23 Okt. 2012

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Click chemistry: A new approach for single cell microbial ecology.

Holger Daims (Vortragende*r)

23 Aug. 2012

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Microbial molecular ecology of nitrification.

Holger Daims (Invited speaker)

20 Juni 2012

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Ecophysiology and evolution of nitrite-oxidizing bacteria: News on the Big Unknown of the N-cycle.

Holger Daims (Invited speaker)

26 März 201229 März 2012

Aktivität: VorträgeVortragAndere



Digital image analysis of microorganisms: From counting to stereology.

Holger Daims (Invited speaker)

14 Juni 201124 Juni 2011

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Ecophysiology and genomics of key nitrite-oxidizing bacteria.

Holger Daims (Invited speaker)

18 Apr. 201120 Apr. 2011

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Novel insights into the ecophysiology and evolution of nitrite-oxidizing bacteria.

Holger Daims (Invited speaker)

30 Nov. 2010

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Metagenomics illuminate the ecophysiology and evolution of nitrite-oxidizing bacteria.

Holger Daims (Invited speaker)

8 Nov. 2010

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Nitrification: Physiology, niche differentiation, and interactions of key players.

Holger Daims (Invited speaker)

5 Okt. 20108 Okt. 2010

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Quantitative FISH and new variations of (F)ISH.

Holger Daims (Invited speaker)

22 Aug. 201027 Aug. 2010

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Genomics and functional analyses of nitrite-oxidizing bacteria.

Holger Daims (Invited speaker)

26 Mai 2010

Aktivität: VorträgeVortragAndere


How to apply genomic info to predict the ecological role of nitrifiers.

Holger Daims (Invited speaker)

11 Apr. 201014 Apr. 2010

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Ecophysiology and genomics of nitrifying microbes in natural and engineered systems.

Holger Daims (Invited speaker)

8 März 2010

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Wastewater Treatment: A Useful Model System for Microbial Ecology.

Holger Daims (Invited speaker)

9 Dez. 200910 Dez. 2009

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Single cell tools to investigate microbial physiology.

Holger Daims (Invited speaker)

15 Nov. 200919 Nov. 2009

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Ecology and evolution of nitrite oxidizers: Insights from in situ tools and environmental genomics.

Holger Daims (Invited speaker)

7 Sep. 200910 Sep. 2009

Aktivität: VorträgeVortragAndere


In situ diversity and niche adaptations of nitrite-oxidizing bacteria.

Holger Daims (Invited speaker)

1 Juli 200910 Juli 2009

Aktivität: VorträgeVortragAndere





Environmental genomics illuminates the biology of key nitrite-oxidizing bacteria.

Holger Daims (Invited speaker)

17 Sep. 2008

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Metagenomics of Nitrospira defluvii illuminates the biology of key nitrite-oxidizing bacteria.

Holger Daims (Vortragende*r)

14 Aug. 200826 Aug. 2008

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Nitrification in biological wastewater treatment: Insights based on molecular approaches.

Holger Daims (Invited speaker)

31 März 2008

Aktivität: VorträgeVortragAndere



Structure-function analysis of microbial biofilms.

Holger Daims (Invited speaker)

20 Sep. 2007

Aktivität: VorträgeVortragAndere



Enigmatic uncultured bacteria in nature and biotechnology.

Holger Daims (Invited speaker)

25 Jan. 2007

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Ecology and genomics of key nitrite oxidizers active in natural and engineered habitats.

Holger Daims (Invited speaker)

20 Aug. 200625 Aug. 2006

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Genomics, ecophysiology and interactions of yet uncultured nitrifying bacteria.

Holger Daims (Invited speaker)

3 Juli 20066 Juli 2006

Aktivität: VorträgeVortragAndere


"Nitrification and Anammox" and "Environmental Genomics" (two talks).

Holger Daims (Invited speaker)

17 Mai 2006

Aktivität: VorträgeVortragAndere



Biodiversity and ecophysiology of N-cycle bacteria.

Holger Daims (Invited speaker)

9 März 200610 März 2006

Aktivität: VorträgeVortragAndere




Ecophysiology and genomics of nitrite-oxidizing bacteria important for wastewater treatment.

Holger Daims (Invited speaker)

21 Aug. 200524 Aug. 2005

Aktivität: VorträgeVortragAndere




Biodiversity and ecophysiology of Nitrospira-like bacteria.

Holger Daims (Invited speaker)

11 Jan. 2005

Aktivität: VorträgeVortragAndere


From 16S rRNA to environmental genomics: microbiology of Nitrospira-like bacteria.

Holger Daims (Invited speaker)

1 Nov. 2004

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Ecophysiology and environmental genomics of yet uncultured nitrite-oxidizing bacteria.

Holger Daims (Vortragende*r)

22 Aug. 200427 Aug. 2004

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Ecology and genomics of uncultured autotrophic nitrite-oxidizers and anaerobic ammonium oxidizers.

Holger Daims (Invited speaker)

1 Aug. 20046 Aug. 2004

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Diversity, Ecophysiology, and Genomics of uncultured Nitrospira-like nitrite-oxidizing bacteria.

Holger Daims (Vortragende*r)

22 März 2004

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Microbial Structure and Community Structure of Flocs.

Holger Daims (Invited speaker)

5 Sep. 2003

Aktivität: VorträgeVortragAndere





Yet unculturable bacteria as major players for nutrient removal in waste water treatment.

Holger Daims (Vortragende*r)

3 Sep. 20008 Sep. 2000

Aktivität: VorträgeVortragAndere


Nitrification in sequencing biofilm batch reactors: lessons from molecular approaches.

Holger Daims (Vortragende*r)

10 Juli 200012 Juli 2000

Aktivität: VorträgeVortragAndere


The biology of Nitrospira-like bacteria in wastewater treatment plants: from structure to function.

Holger Daims (Vortragende*r)

12 März 200016 März 2000

Aktivität: VorträgeVortragAndere



Nitrospira-like bacteria play a key role in nitrifying biofilms.

Holger Daims (Vortragende*r)

7 März 199910 März 1999

Aktivität: VorträgeVortragAndere



Physiologie und ökologische Bedeutung von Comammox

Daims, H.

1/12/1731/05/21

Projekt: Forschungsförderung


Ökologie neuer Nitritoxidierer aus dem Stamm Chloroflexi

Daebeler, A., Daims, H., Urbanic, B. & Holzleitner, N.

1/10/1731/12/20

Projekt: Forschungsförderung


SymPathInfect

Horn, M., Daims, H., Urbanic, B. & Holzleitner, N.

1/10/1524/09/18

Projekt: Forschungsförderung


Mikrodiversität Bakterien

Daims, H., Holzleitner, N. & Urbanic, B.

1/03/1528/02/18

Projekt: Forschungsförderung


Eukaryotische Gene

Horn, M., Daims, H., Holzleitner, N. & Urbanic, B.

27/12/1331/12/17

Projekt: Forschungsförderung


Unters.Nitrit-oxid.Bakterien

Daims, H., Holzleitner, N. & Urbanic, B.

4/12/1231/01/18

Projekt: Forschungsförderung


EVOCHLAMY: The Evolution of the Chlamydiae - an Experimental Approach

Horn, M., Daims, H. & Kim, S.

1/01/1231/12/16

Projekt: Forschungsförderung


Amöben:Vehikel f.Bakterien

Horn, M. & Daims, H.

3/05/1130/11/15

Projekt: Forschungsförderung


Symbionten d.Schmierläuse

Horn, M. & Daims, H.

10/05/109/05/13

Projekt: Forschungsförderung


Multiphasic comparative analysis

Daims, H.

1/01/1030/09/14

Projekt: Forschungsförderung


MICDIF: Linking Microbial Diversity and Functions across Scales and Ecosystems

Richter, A., Battin, T., Daims, H., Wagner, M., Strauss, J., Sterflinger-Gleixner, K., Riedel, K., Eberl, L., Psenner, R., Zechmeister-Boltenstern, S., Jandl, R., Wanek, W., Obersteiner, M., Schmid, E., Schleper, C. & Rattei, T.

1/12/0630/11/09

Projekt: Forschungsförderung


EURODIVERSITY-COMIX

Daims, H.

1/11/0531/10/08

Projekt: Forschungsförderung


Nitrospira

Daims, H.

1/01/0431/03/08

Projekt: Forschungsförderung


Institut für Analytische Chemie

Währinger Straße 38
1090 Wien

T: +43-1-4277-91204

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